Такая ситуация возможна, если в настройках синхронизации  в retailcrm.services выбран всего 1 тип доставки, например, "Наложенный платеж и объявленная ценность", а в заказе не используется наложенный платеж. При работе с модулем учитывайте выбранные тарифы в retailcrm.services и опции в заказе в retailCRM